Alors que la région est à la recherche des chefs de clan disparus d'Hisui, un gardien amnésique est à nouveau entraîné dans l'espace-temps. Pourtant, le changement de cap vers Pasio semble favorable à première vue. Ses souvenirs d'Hisui sont intacts, les chefs de clan sont connus et le seul homme dont il se souvenait à peine de sa vie antérieure est là.
Tout comme le frère jumeau de l'homme.
Pendant le chaos du naufrage du SS Anne, Ash est séparé et s'échoue sur une île étrange remplie de Pokémon du monde entier. Alors qu'il tente de survivre sur cette île étrange, il découvre que son corps change et que la relation entre lui et ses Pokémon devient de plus en plus intime, tout en tissant de nouveaux liens avec les étranges et incroyables Pokémon de l'île.